| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS | | BYK-23-113 | BİYOMOLEKÜLER TERMODİNAMİK | Seçmeli | 1 | 2 | 6 |
|
| Dersin Seviyesi |
| Yüksek Lisans |
| Dersin Amacı |
| Bu ders, öğrencilere biyolojik ve kimyasal bilimlerdeki moleküler sistemlerin davranışını kantitatif düzeyde, klasik ve istatistiksel termodinamiğin formalizmi aracılığıyla anlamak için gerekli kavram ve becerileri tanıtmayı amaçlamaktadır. |
| Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri |
| Doç. Dr. Tuğba bayraktutan |
| Öğrenme Çıktıları |
| 1 | 1. Sistem, çevre, denge ve tersinirlik ile ilgili bazı temel kavramları tanıtır. | | 2 | 2. İkinci yasayı ve entropiyi tanıtır. | | 3 | 3. İzole edilmiş bir sistem için termodinamik potansiyel olarak entropi fikrini alır ve onu izole edilmemiş sistemler için potansiyellere dönüştürür. | | 4 | 4. Basit sistemlerde faz dengesini tartışmak için kimyasal potansiyel kavramını kullanır. | | 5 | 5. Reaksiyon termodinamiğini biyolojideki temel bir sürece uygular. |
|
| Öğrenim Türü |
| Birinci Öğretim |
| Dersin Ön Koşulu Olan Dersler |
| yok |
| Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar |
| 1. Sistem, çevre, denge ve tersinirlik ile ilgili bazı temel kavramları tanıtır.
2. İkinci yasayı ve entropiyi tanıtır.
3. İzole edilmiş bir sistem için termodinamik potansiyel olarak entropi fikrini alır ve onu izole edilmemiş sistemler için potansiyellere dönüştürür.
4. Basit sistemlerde faz dengesini tartışmak için kimyasal potansiyel kavramını kullanır.
5. Reaksiyon termodinamiğini biyolojideki temel bir sürece uygular. |
| Dersin İçeriği |
| Bu dersin hedefleri; Termodinamiğin fikirlerini ve denklemlerini derinlemesine ve sezgisel olarak anlamak ve termodinamik çerçeveyi kullanarak verileri analiz etmek için hesaplama ve istatistiksel beceriler sağlamak. |
| Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği |
|
| 1 | Denge, Durum Değişiklikleri ve Tersinirlik | | | | 2 | Isı, İş | | | | 3 | Tersinir Süreçler ve Tersinmez Süreçler | | | | 4 | Entropi Hesaplamaları, Entropi Değişiklikleri, Kesirli Popülasyonlar | | | | 5 | İç enerji | | | | 6 | Gibbs-Duhem İlişkisi | | | | 7 | Faz Geçişlerini Tanımlamak için Kimyasal Potansiyelleri Kullanma | | | | 8 | Konformasyonel Denge | | | | 9 | İstatistiksel Termodinamik ve Ensemble Metodu | | | | 10 | Çevreleriyle Etkileşen Topluluklar | | | | 11 | Tek Moleküller ve Kimyasal Reaksiyonlar için Bölme Fonksiyonları | | | | 12 | Helix-kuyruk Geçişi | | | | 13 | Makroskopik Perspektiften Ligand Bağlama Dengesi | | | | 14 | Mikroskobik Perspektiften Ligand Bağlama Dengesi | | |
|
| Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar |
| 1. Biomolecular Thermodynamics_ From Theory to Application- Douglas Barrick - Taylor & Francis_CRC Press (2017)
2. Entropy and Free Energy in Structural Biology-Hagai Meirovitch- CRC Press 2020 |
| Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları |
|
| Değerlendirme | |
| Ara Sınav | 1 | 100 | | TOPLAM | 100 | |
| Final Sınavı | 1 | 100 | | TOPLAM | 100 | | Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 50 | | Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 50 | | TOPLAM | 100 |
| | Dersin Sunulduğu Dil | | | Staj Durumu | |
|
| İş Yükü Hesaplaması |
|
| Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Final Sınavı | 1 | 1 | 1 |
| Bütünleme Sınavı | 1 | 15 | 15 |
| Derse Katılım | 14 | 1 | 14 |
| Soru-Yanıt | 14 | 1 | 14 |
| Beyin Fırtınası | 14 | 1 | 14 |
| Seminer | 1 | 15 | 15 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 5 | 70 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 15 | 15 |
|
| Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi |
| ÖÇ1 | 5 | | | | | ÖÇ2 | | 5 | | | | ÖÇ3 | | | 5 | | | ÖÇ4 | | | | 5 | | ÖÇ5 | | | | 4 |
|
| * Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek |
|
|
|
|
Iğdır University, Iğdır / TURKEY • Tel (pbx): +90 476
226 13 14 • e-mail: info@igdir.edu.tr
|