Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS | TBT-23-120 | MOLEKÜLER FİLOGENETİK ANALİZ | Seçmeli | 1 | 3 | 6 |
|
Dersin Seviyesi |
Yüksek Lisans |
Dersin Amacı |
Bu dersin amacı Yüksek Lisans öğrencilerine moleküler filogenetik analiz yöntemlerini ve elde edilen sonuçların yorumlanmasını öğretmektir. |
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri |
Dr. Öğr. Üyesi Kaan Hürkan |
Öğrenme Çıktıları |
1 | 1) Polimorfizm ve önemi | 2 | 2) Moleküler markörler | 3 | 3) Filogenetik ağaçları oluşturma basamakları | 4 | 4) Filogenetik ağaçları oluşturmak için kullanılan bilgisayar programları | 5 | 5) Filogenetik ağaçların karşılaştırılması ve yorumlanması |
|
Öğrenim Türü |
Birinci Öğretim |
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler |
|
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar |
|
Dersin İçeriği |
Polimorfizm ve önemi, Moleküler markörler, Filogenetik ağaçları oluşturma basamakları, Filogenetik ağaçları oluşturmak için kullanılan bilgisayar programları, Filogenetik ağaçların karşılaştırılması ve yorumlanması |
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği |
|
1 | Moleküler Evrimin Temelleri, Dizi Veri Tabanları ve Veri Tabanlarında Arama Yapma | | | 2 | Karşılıklı ve Çoklu Dizi Hizalaması | | | 3 | Filogenetik Ağaçları Anlamak | | | 4 | Genetik Uzaklık, Nükleotid Değişim Modelleri | | | 5 | Genetik Uzaklık Yöntemleriyle Filogenetik Analiz | | | 6 | Maximum-Likelihood Yöntemiyle Filogenetik Analiz | | | 7 | MrBayes ile Bayesian Filogenetik Analiz | | | 8 | PAUP ile Parsimoni Filogenetik Analiz | | | 9 | Modellerin ve Ağaçların Testi | | | 10 | Filogenetik Analiz İçin Uygun Moleküler Markörlerin Seçimi | | | 11 | Filogenetik Analiz İçin Uygun Filogenetik Yaklaşım Seçimi | | | 12 | | Öğrenci Uygulaması: Verileri elde etme, hizalama, uygun yaklaşımı belirleme, filogenetik ağaç çizme ve yorumlama. | | 13 | Moleküler Filogenetik Analizlerde Kullanılan Diğer Bilgisayar Programlarının Tanıtımı | | | 14 | Moleküler Filogenetik Analizlerde Kullanılan Diğer İnternet Sitelerinin Tanıtımı | | |
|
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar |
Lemey, P., Salemi, M., Vandamme, A. M., (Ed.)., 2009.
The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing 2nd Edition. Cambridge: Cambridge University Press. ISBN: 9780521730716
Salemi, M., Vandamme, A. M., (Ed.)., 2003.
The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing 1st Edition. Cambridge: Cambridge University Press. ISBN: 9780521803908 |
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları |
|
Değerlendirme | |
Ara Sınav | 1 | 100 | TOPLAM | 100 | |
Rapor | 1 | 100 | TOPLAM | 100 | Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | TOPLAM | 100 |
| Dersin Sunulduğu Dil | Türkçe | Staj Durumu | |
|
İş Yükü Hesaplaması |
|
Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
Bireysel Çalışma | 14 | 8 | 112 |
Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
Ev Ödevi | 1 | 10 | 10 |
|
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi |
|
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek |
|
|
Iğdır University, Iğdır / TURKEY • Tel (pbx): +90 476
226 13 14 • e-mail: info@igdir.edu.tr
|