| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS | | TBİ-23-165 | MOLEKÜLER FİLOGENETİK ANALİZ | Seçmeli | 1 | 3 | 6 |
|
| Dersin Seviyesi |
| Yüksek Lisans |
| Dersin Amacı |
| Bu dersin amacı Yüksek Lisans öğrencilerine moleküler filogenetik analiz yöntemlerini ve elde edilen sonuçların yorumlanmasını öğretmektir. |
| Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri |
| Dr. Öğr. Üyesi Kaan Hürkan |
| Öğrenme Çıktıları |
| 1 | 1) Polimorfizm ve önemi | | 2 | 2) Moleküler markörler | | 3 | 3) Filogenetik ağaçları oluşturma basamakları | | 4 | 4) Filogenetik ağaçları oluşturmak için kullanılan bilgisayar programları | | 5 | 5) Filogenetik ağaçların karşılaştırılması ve yorumlanması |
|
| Öğrenim Türü |
| Birinci Öğretim |
| Dersin Ön Koşulu Olan Dersler |
|
| Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar |
|
| Dersin İçeriği |
| Polimorfizm ve önemi, Moleküler markörler, Filogenetik ağaçları oluşturma basamakları, Filogenetik ağaçları oluşturmak için kullanılan bilgisayar programları, Filogenetik ağaçların karşılaştırılması ve yorumlanması |
| Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği |
|
| 1 | Moleküler Evrimin Temelleri, Dizi Veri Tabanları ve Veri Tabanlarında Arama Yapma | | | | 2 | Karşılıklı ve Çoklu Dizi Hizalaması | | | | 3 | Filogenetik Ağaçları Anlamak | | | | 4 | Genetik Uzaklık, Nükleotid Değişim Modelleri | | | | 5 | Genetik Uzaklık Yöntemleriyle Filogenetik Analiz | | | | 6 | Maximum-Likelihood Yöntemiyle Filogenetik Analiz | | | | 7 | MrBayes ile Bayesian Filogenetik Analiz | | | | 8 | PAUP ile Parsimoni Filogenetik Analiz | | | | 9 | Modellerin ve Ağaçların Testi | | | | 10 | Filogenetik Analiz İçin Uygun Moleküler Markörlerin Seçimi | | | | 11 | Filogenetik Analiz İçin Uygun Filogenetik Yaklaşım Seçimi | | | | 12 | | Öğrenci Uygulaması: Verileri elde etme, hizalama, uygun yaklaşımı belirleme, filogenetik ağaç çizme ve yorumlama. | | | 13 | Moleküler Filogenetik Analizlerde Kullanılan Diğer Bilgisayar Programlarının Tanıtımı | | | | 14 | Moleküler Filogenetik Analizlerde Kullanılan Diğer İnternet Sitelerinin Tanıtımı | | |
|
| Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar |
| Lemey, P., Salemi, M., Vandamme, A. M., (Ed.)., 2009.
The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing 2nd Edition. Cambridge: Cambridge University Press. ISBN: 9780521730716
Salemi, M., Vandamme, A. M., (Ed.)., 2003.
The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing 1st Edition. Cambridge: Cambridge University Press. ISBN: 9780521803908 |
| Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları |
|
| Değerlendirme | |
| Ara Sınav | 1 | 100 | | TOPLAM | 100 | |
| Rapor | 1 | 100 | | TOPLAM | 100 | | Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | | Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | | TOPLAM | 100 |
| | Dersin Sunulduğu Dil | | Türkçe | | Staj Durumu | |
|
| İş Yükü Hesaplaması |
|
| Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 8 | 112 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Ev Ödevi | 1 | 10 | 10 |
|
| Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi |
|
| * Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek |
|
|
|
|
Iğdır University, Iğdır / TURKEY • Tel (pbx): +90 476
226 13 14 • e-mail: info@igdir.edu.tr
|